Archeopteryx potansiyel olarak büyük ve açıklamalı filogenetik ağaçların görselleştirilmesi, analizi ve düzenlenmesi için bir yazılım aracıdır.Archaeopteryx (ATV'nin halefi) tamamen Java programlama dilinde yazılmıştır (ormancı kütüphanelerine dayanır).