AtomEye, milyonlarca atom ile moleküler dinamik simülasyonlarının çıktısını işleyebilecek kadar hızlı atomistik görüntüleme yazılımıdır.Tam üç boyutlu navigasyon, özelleştirilebilir bağ ve koordinasyon numarası hesaplaması, keyfi kullanıcı tanımlı miktarların renk kodlaması, yerel atom suşu değişmez, renkli atom döşeme ve izleme, 16 kesme düzlemine kadar, periyodik sınır koşulu ile paralel ve perspektif projeksiyonları içerirçeviriler, JPEG, PNG ve EPS ekran görüntüleri ve animasyon komut dosyaları ....