Cytoscape, karmaşık ağları görselleştirmek ve bunları her tür özellik verisine entegre etmek için açık kaynaklı bir yazılım platformudur.Biyoinformatik, sosyal ağ analizi ve semantik web gibi çeşitli sorun alanları için birçok eklenti mevcuttur.Cytoscape, moleküler ve sistem biyolojisi, genomik ve proteomik alanlarında birçok kullanım durumunu destekler: Moleküler ve genetik etkileşim veri kümelerini birçok formatta yükleyin Küresel veri kümelerini ve fonksiyonel ek açıklamaları projelendirin ve entegre edin Bu veriler arasında güçlü görsel eşlemeler oluşturun Cytoscape eklentilerini kullanarak gelişmiş analiz ve modelleme gerçekleştirin Görselleştirinve Reactome veya KEGG gibi insan tarafından seçilen yol veri kümelerini analiz edebilir.